Elles englobent la chapelle des Princes et la Nouvelle Sacristie. Projetée sous Côme Ier mais réalisée au 17e s., la chapelle des Princes, chapelle funéraire des grands-ducs, impressionne par ses écrasantes proportions et son aspect funèbre. La Nouvelle Sacristie, bâtie pour accueillir les superbes tombeaux des Médicis, est la première oeuvre d'architecture de Michel-Ange. Laissée inachevée par l'artiste, Vasari et Ammannati la complétèrent plus tard.